L'obiettivo della ricerca, svolto in collaborazione con il Dott. Vincenzo Carciotto della Wyeth Divisione FDAH di Catania, é lo sviluppo e la messa a punto di un metodo analitico per la caratterizzazione di un profilo proteico di Pharmamedia, fonte di azoto organico utilizzata nel processo industriale per la biosintesi del metabolita F-Alpha ad opera del microrganismo S. cyaneogriseus subs. noncyanogenus.
Il programma sperimentale é finalizzato all'analisi comparativa della composizione proteica di tre diversi campioni di Pharmamedia, di cui é nota una differente risposta in produttivitá, testati precedentememte sia su terreni di fermentazione da laboratorio che nei fermentatori industriali di produzione.
Lo sviluppo del progetto di ricerca comprende piú fasi, ai fini di sviluppare un protocollo di estrazione esaustiva della frazione proteica da Pharmamedia, ed individuare la migliore procedura analitica. Gli estratti proteici sono analizzati mediante RP/HPLC con rivelazione UV, accoppiata con analisi MALDI/MS off-line, MALDI/MS, elettroforesi SDS-PAGE, elettoforesi 2D-PAGE combinata con digestione enzimatica degli spot di interesse, MALDI/MS dei digeriti ed individuazione delle proteine mediante ricerca bioinformatica.
Inoltre, considerata la carenza di dati riguardanti la caratterizzazione delle proteine di semi di cotone emersa dalla ricerca bibliografica, gli stessi procedimenti di estrazione ed analisi sono stati eseguiti su un campione di semi di cotone, previa estrazione dei lipidi. L'analisi comparativa di questo campione é stata ritenuta utile allo scopo di avere dei dati di riferimento su un campione non sottoposto ai trattamenti tecnologici a cui sono invece sono soggetti i lotti di Pharmamedia.

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